연세의료원에 500병상을 갖춘 최첨단 암센터가 설립되고 3,000평 규모의 초현대식 장례식장이 생긴다. 연세의료원은 최근 21세기 글로벌병원, 아시아 허브병원으로 거듭나기 위해 5단계의 마스터플랜을 발표했다. 1단계로 의료원은 세브란스병원 기존 본관과 별관의 리노베이션을 시행한다. 노후된 본관과 별관 시설을 개보수하여 본관건물에는 호스피스병동, 임상시험센터 등을 설치하고, 종합관에 있는 교육시설 및 행정부서를 이전하게 된다. 별관건물은 새병원과의 조화를 고려하여 전면적인 리노베이션 후 2006년 1월경에 국내 최고 수준의 아동병원을 설립할 계획이며 새 아동병원 명칭은 공모 및 심사중이다. 2단계는 종합관과 함께 기존 병원의 외래주차장과 기존 외래진료소를 순차적으로 철거하게 된다. 이번 마스터플랜의 핵심이 될 3단계 사업은 기존 종합관이 철거된 자리에 9,500평 규모의 지하 5층, 지상 6층 새로운 종합관이 신축된다. 새 종합관에는 3,000평 규모의 초현대적인 장례식장이 들어선다. 또 서울역 연세빌딩의 건진센터를 옮겨 1,000평 규모의 건강진단의원으로 재정비해 국내최고의 건강검진서비스를 제공하게 된다. 또 그동안 임시로 본관건물로 이전하였던 의료원 행정본부, 보건대학원 등 기존 시설들을 다시 옮겨오게 된다. 이어 기존 외래진료소가 철거된 자리에 지하 5층 지상 12층에 500병상 규모의 최첨단 암센터가 2007년말에 건립된다. 이곳으로 기존 암센터 시설과 본관 병동 시설이 이전하게 된다. 특히 신축 암센터는 최첨단의 시설과 장비를 구비하고 각종 암 유형별로 전문 진료시스템을 구축하여 암 질환 치료의 국제적 경쟁력을 확보하게 될 것이다. 또한 호스피스, 통증치료 등의 '휴먼 터치(human touch) 서비스'를 강화하여 암환자들의 진료시 안락성을 극대화 시킬 예정이다. 암센터 완공에 이어 구 본관 건물은 헐리게 되며 그 자리에 대규모 생태공원을 만들어 환자들은 자연친화적인 환경속에서 진료를 받을 수 있게 된다. 이 생태공원은 치유 및 휴식 공간은 물론 환자들에게 맑은 공기를 제공하는 공기정화기의 역할도 담당하게 된다. 4단계는 의과대학 신축 사업으로 기존 암센터를 철거하고 그 자리에 12,000평 규모의 의과대학을 신축하는 것이다. 그동안 서로 떨어져 있던 의과대학과 본교를 인접하도록 신축함으로써 장래 바이오메디컬 연구시설과의 연계를 통해 최첨단 의학기술 발전을 위한 연구기반을 구축하게 된다. 마지막 5단계는 마스터플랜의 마지막 사업으로 기존의 의과대학을 철거하고 12,000평 규모의 제2종합관을 신축하게 되며 제2종합관은 종합관과 함께 의료행정 및 서비스의 중추적 역할을 담당하게 된다. 연세의료원측은 "마스터플랜에 따라 최종 완성된 우리의료원은 최첨단, 친환경을 내세운 세계 최고수준의 메디컬 타운(Medical Town)으로 변모하게 되어 미션과 비전을 실천하는 글로벌병원, 아시아 허브병원으로 거듭나게 될 것"이라고 강조했다.